Femte amfibiebataljonen har stor eldkraft, god uthållighet och stor rörlighet med bland annat robotsystem och granatkastare, väl fungerande underhållsfunktioner, snabbgående stridsbåtar och lätta trossbåtar. Förbandet uppträder med fördel snabbt, dolt och i mindre enheter.
Femte amfibiebataljonen utbildar kustjägare och amfibiesoldater med skiftande uppgifter, allt ifrån nationella till internationella insatser. Bataljonen utbildar och anställer olika kategorier av personal till de ingående kompanierna.
Femte amfibiebataljonen är indelad i ledningskompani, bekämpningskompani, kustjägarkompani, amfibieskyttekompani och ett underhållskompani. Bataljonen är sjörörlig med förmåga att förflytta sig på land.
Femte amfibiebataljonen är en av två bataljoner i Sverige och är ett av flera tillväxtförband. Den Andra amfibiebataljonen tillhör Stockholms amfibieregemente. De två bataljonerna samövar ofta för att kunna stödja varandra och verka tillsammans i olika miljöer.