Tillsyn och kontroll innebär en självständig granskning av att gällande lagstiftning följs. När inspektören utövar sin tillsyns- och kontrollfunktion är han eller hon därför inte underställd överbefälhavaren.

Varje år genomför FIHM ett stort antal inspektioner, tillsyns- och kontrollbesök på garnisoner, anläggningar och vid övningar, både inom Sverige och på platser där Försvarsmakten verkar internationellt.

Den person som innehar befattningen Försvarsinspektör för hälsa och miljö utses av regeringen. Utöver Försvarsinspektören själv arbetar även inspektörer inom FIHM:s olika ansvarsområden samt jurist, administratör och stabschef på avdelningen.

Regeringen föreskriver i 3 c § förordning (2007:1266) med instruktion till Försvarsmakten att myndigheten ska bedriva militär luftfart. Det yttersta ändamålet med den militära luftfarten är att tillförsäkra att Sverige har effektiva flygstridskrafter som bidrar till att lösa Försvarsmaktens huvuduppgift, att kunna genomföra väpnad strid. Detta innebär att den militära luftfarten inte kan regleras på samma sätt som civil luftfart eller annan luftfart för statsändamål. Försvarsmakten ges därför i 14 kap. 2 § luftfartsförordningen (2010:770) föreskriftsrätt för militär luftfart.

Föreskrifter för militär luftfart meddelas genom regler för militär luftfart (RML). Reglerna utarbetas av militära flyginspektionen och beslutas av överbefälhavaren. Regler för militär luftfart ska följas av samtliga verksamhetsutövare inom det militära luftfartssystemet och utformas så att de även omfattar sådan verksamhet som enskild bedriver. Regler för militär luftfart gäller således även utanför Försvarsmakten och även utanför Sveriges gränser.

Den militära flyginspektionen utövar tillsyn över att bestämmelserna i luftfartslagen (2010:500) och de i lagen angivna föreskrifterna följs i fråga om militär luftfart. Tillsyn över militär luftfart omfattar inträdeskontroll, funktionstillsyn, avvecklingskontroll samt analys och hantering av förändringar av det militära luftfartssystemet. Tillsynen utövas med oberoende och självständighet och flygsäkerhetsinspektören är i tillsynsrollen inte underställd överbefälhavaren.

För att bedriva verksamhet inom det militära luftfartssystemet krävs tillstånd, detta gäller verksamhetsutövare såväl inom som utanför Försvarsmakten. Militära flyginspektionen bereder flygsäkerhetsinspektörens beslut om utfärdande, begränsning och återkallande av verksamhetstillstånd.

I militära flyginspektionen ingår flygsäkerhetsinspektörens flygmedicinske rådgivare som ska utöva tillsyn över de flygmedicinska undersökningar som genomförs inom det militära luftfartssystemet samt utarbeta de föreskrifter som behövs för den militära flygmedicinska verksamheten.

Försvarsmakten bedriver komplex verksamhet, ibland med undantag från lagar, förordningar och externa föreskrifter. Försvarsmaktens personal ska öva på samma sätt som vi avser kunna strida. Säkerhetsinspektionen utvecklar regler och inspekterar verksamhetssäkerheten för en säker arbetsmiljö och så att verksamheten inte tillför samhället onödiga risker.

Säkerhetsinspektionen är indelad i två avdelningar: en marksäkerhetsinspektion och en sjösäkerhetsinspektion.

Marksäkerhetsinspektionen 

Marksäkerhetsinspektionen (MARKI) utvecklar regler, bestämmelser och handböcker samt genomför granskning, inspektion och tillsyn av militär marksäkerhet vid alla förband (även vid internationella insatser), skolor och centrum. I marksäkerhetsinspektionen ingår inspektionssektionen (InspS) som genomför inspektioner, beslutar certifikat och behörighetsbevis avseende trafikvärdighet med mera.

Marksäkerhetsinspektionen föreslår även nödvändiga undantag från föreskrifter inom ramen för militär marksäkerhet och genomför viss tillsyn i fråga om hantering och import av brandfarliga och explosiva varor på Försvarets materielverk, Totalförsvarets forskningsinstitut och Fortifikationsverket.

Sjösäkerhetsinspektionen 

Sjösäkerhetsinspektionen (SJÖI) utvecklar regelverk, genomför tillsynsverksamhet och ger stöd så att verksamheten följer utvecklingen av omvärldens sjösäkerhetssystem, civilt och militärt. I sjösäkerhetsinspektionen ingår sektionen för marinens fartygsinspektion (MFI) som genomför sjövärdighetsbesiktningar och sjövärdighetsinspektioner av örlogsfartyg. Här genomförs även dyksäkerhetsbesiktningar och dyksäkerhetsinspektioner samt utfärdande av såväl behörighetsbevis som miljöcertifikat med mera. Sjösäkerheten inom den militära sjöfarten regleras i regler för militär sjöfart (RMS) och tillämpas på all verksamhet inom Försvarsmakten med örlogsfartyg och dykerisystem.

Operationsledningen är en del av Högkvarteret och består av ett par hundra personer. Chefen för operationsledningen har ansvar för att försvara Sverige och allierade mot väpnat angrep, hävda Sveriges territoriella integritet och skydda svenska intressen. Det innebär också att planera och genomföra operationer, både nationellt och internationellt och att integrera alla nationella försvarsplaner med Natos planer. Fokus för den svenska operationsplaneringen är Nordkalotten, Östersjöinloppen och Östersjön.