Generalläkaren är därvid behörig myndighet att utöva offentlig kontroll enligt Europaparlamentets och rådets förordning (EG) nr 882/2004 av den 29 april 2004 om offentlig kontroll för att säkerställa kontrollen av efterlevnaden av foder- och livsmedelslagstiftningen samt bestämmelserna om djurhälsa och djurskydd.
Generalläkaren får meddela interna föreskrifter för Försvarsmakten för efterlevnaden av gällande bestämmelser inom området. När generalläkaren utövar sin tillsyns- eller kontrollfunktion, är generalläkaren inte underställd överbefälhavaren. Inom miljö- och hälsoskydd har Generalläkaren dessutom tillsyn över Försvarets Materielverk (FMV), Försvarets Radioanstalt (FRA) och Fortifikationsverket (FORTV).
Tillsynsbegreppet innebär verksamhet som avser självständig granskning för att kontrollera om tillsynsobjektet uppfyller krav som följer lagar och andra bindande föreskrifter och vid behov kan leda till beslut om åtgärder som syftar till att åstadkomma rättelse av den objektsansvarige.
Det strikt avgränsade tillsynsbegreppet hindrar inte att tillsynsmyndigheten även i fortsättningen kan ha till uppgift att arbeta främjande och förebyggande för att effektivt uppnå lagstiftningens mål inom ramen för upplysning och vägledning. Regeringen understryker att det i allmänhet inte är lämpligt att tillsynsmyndigheten uppträder som konsult och ger råd om hur tillsynsobjekten ska agera i specifika ärenden. Tillsyn sker även under övningar i fält och vid insats.
Hur genomför Generalläkaren sin tillsyn?
Generalläkaren genomför årligen 10-12 större inspektioner både i Sverige och utomlands. Dessutom görs cirka 400 tillsynsbesök på olika garnisoner, förband och anläggningar varje år. Generalläkaren har möjlighet att förelägga myndigheterna att vidta nödvändiga åtgärder för att uppfylla lagens krav.