Försvarsmaktens Sjukvårdscentrum, FSC, bildades 1994 genom en sammanslagning av Försvarets sjukvårdsstyrelse (SjvS) Karlstad, Försvarets sjukvårdshögskola (FSjvHS) Stockholm, delar av Underhållsskolan (US) Skövde och Marinens sjukvårdsskola.
Efter ett riksdagsbeslut flyttades FSC den första september 2005 från Hammarö i Karlstad till Göteborg.
Under 2006 och efter en särskild utredning beslutade man att samla de försvarsmedicinska kompetenserna. Flygmedicincentrum (FMC), Dyk- och Navalmedicin (DNC) samt Försvarsmaktens sjukvårdscentrum (FSC) slogs samman till en och samma organisation. Den nya enheten fick namnet Försvarsmedicincentrum (FömedC).
En relaterad utbildningsverksamhet finns i sin helhet i Linköping, men leds av FömedC.